Bioinformatik på nätet
Kursplan, Grundnivå, 1BG421
Kursen är avvecklad.
- Kod
- 1BG421
- Utbildningsnivå
- Grundnivå
- Huvudområde(n) med fördjupning
- Biologi G2F
- Betygsskala
- Underkänd (U), godkänd (3), icke utan beröm godkänd (4), med beröm godkänd (5)
- Fastställd av
- Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden, 17 januari 2008
- Ansvarig institution
- Institutionen för biologisk grundutbildning
Behörighetskrav
För tillträde till kursen fordras kunskaper motsvarande Biologi 80 hp och kemi 30 hp alt. kemi 90 hp varav biokemi 30 hp samt biologi 15 hp.
Mål
Studenten skall efter genomgången kurs kunna:
- Söka efter biologisk information på webben.
- Använda enkla datorbaserade verktyg för studier av DNA-sekvenser och proteinstrukturer.
- Lösa biologiska problem med hjälp av bioinformatiska verktyg.
- Tolka resultat vid användning av datorbaserade metoder.
Innehåll
Följande problemområden ingår: Sammanställning av sekvensdata. Grundläggande sekvensanalys. Databaser och databassökningar. Mönster i DNA-sekvenser. Sekundärstrukturer. Proteiners tredimensionella strukturer. Linjeringar. Fylogenetiska rekonstruktioner. Metaboliska rekonstruktioner. Jämförande analyser av kompletta genom.
Undervisning
Undervisningen ges i form av en serie problembaserade datorövningar.
Examination
För att kursen skall bedömas med betyget godkänd fordras att de problembaserade datorövningarna bedömts godkända (3 hp). Dessutom anordnas ett övergripande prov vid slutet av kursen (2 hp).
Litteraturlista
Litteraturlista saknas.