Bioinformatik på nätet

5 hp

Kursplan, Grundnivå, 1BG421

Det finns en senare version av kursplanen.
Kod
1BG421
Utbildningsnivå
Grundnivå
Huvudområde(n) med fördjupning
Biologi G2F
Betygsskala
Underkänd (U), godkänd (3), icke utan beröm godkänd (4), med beröm godkänd (5)
Fastställd av
Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden, 21 april 2009
Ansvarig institution
Institutionen för biologisk grundutbildning

Behörighetskrav

Biologi 60 hp alternativt biologi 45 hp samt 15 hp kemi eller geovetenskap.

Mål

Efter godkänd kurs ska studenten kunna:

  • Söka efter biologisk information på webben.
  • Använda enkla datorbaserade verktyg för studier av DNA-sekvenser och proteinstrukturer.
  • Lösa biologiska problem med hjälp av bioinformatiska verktyg.
  • Tolka resultat vid användning av datorbaserade metoder.

Innehåll

Följande problemområden ingår: Sammanställning av sekvensdata. Grundläggande sekvensanalys. Databaser och databassökningar. Mönster i DNA-sekvenser. Sekundärstrukturer. Proteiners tredimensionella strukturer. Linjeringar. Fylogenetiska rekonstruktioner. Metaboliska rekonstruktioner.

Undervisning

Undervisningen ges i form av en serie problembaserade datorövningar.

Examination

För att kursen skall bedömas med betyget godkänd fordras att de problembaserade datorövningarna bedömts godkända (3 hp). Dessutom anordnas ett övergripande prov vid slutet av kursen (2 hp).

Litteraturlista saknas.

FÖLJ UPPSALA UNIVERSITET PÅ

facebook
instagram
twitter
youtube
linkedin