Röntgenkristallografi
Kursplan, Avancerad nivå, 1MB443
- Kod
- 1MB443
- Utbildningsnivå
- Avancerad nivå
- Huvudområde(n) med fördjupning
- Molekylär bioteknik A1F, Teknik A1F
- Betygsskala
- Underkänd (U), godkänd (3), icke utan beröm godkänd (4), med beröm godkänd (5)
- Fastställd av
- Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden, 16 mars 2010
- Ansvarig institution
- Institutionen för biologisk grundutbildning
Behörighetskrav
120 hp inklusive Molekylär och statistisk mekanik, Genomik experimentella metoder, Bioteknisk metodik.
Mål
Denna kurs är en introduktion till makromolekylär röntgenkristallografi i allmänhet och med särskild inriktning mot kristallografi av proteiner.
Efter godkänd kurs skall studenten kunna
- praktiskt genomföra enkla kristallisationsexperiment
- redogöra för grunderna i kristallers symmetri och grundläggande begrepp inom röntgenkristallografisk teori
- redogöra för grundläggande metoder som används inom makromolekylär kristallografi
- bygga modeller av makromolekyler med hjälp av elektrontäthetskartor
- analysera sådana modellers möjliga fel med hjälp av olika valideringsmetoder
Innehåll
Kursen ger en praktisk orientering i röntgenkristallografiska metoder och en introduktion till teorin för kristallografi. Denna omfattar Fouriertransformationer, kristallografi, bestämning av rymdkoordinater, datainsamling och experimentell bestämning av faser (inkluderande metoderna isomorf ersättning, molekylär ersättning och MAD- fasning). Tolkning av elektrontäthetskartor som tredimensionella strukturer diskuteras liksom metoder att förfina makromolekylära strukturer.
Laborationer: Högupplösande datorgrafik för arbete med makromolekyler och kristallografi. Preparation av proteinkristaller. Uppsamling av diffraktionsdata med tvådimensionella ytdetektorer.
Undervisning
Undervisningen ges i form av föreläsningar, laborationer och datorövningar. Deltagande i laborationer
och datorövningar är obligatorisk.
Examination
Skriftligt prov (4 hp) vid slutet av kursen. I kursen ingående övningar och laborationer är tillsammans poängsatta med (1 hp).
Litteraturlista
Litteraturlista saknas.