Tillämpad bioinformatik
Kursplan, Avancerad nivå, 1MB513
- Kod
- 1MB513
- Utbildningsnivå
- Avancerad nivå
- Huvudområde(n) med fördjupning
- Bioinformatik A1F, Teknik A1F
- Betygsskala
- Underkänd (U), godkänd (G)
- Fastställd av
- Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden, 7 mars 2011
- Ansvarig institution
- Institutionen för biologisk grundutbildning
Behörighetskrav
120 hp samt Genombioinformatik.
Mål
Kursen fokuserar på att tillämpa förvärvade kunskaper i bioinformatik på biologiska problem.
Efter godkänd kurs skall studenten kunna
- tillgodogöra sig vetenskaplig litteratur och innehåll i bioinformatiska databaser
- definiera ett biologiskt problem från pågående forskning i bioinformatiska termer samt planera och genomföra ett projekt för att lösa problemet
- tillämpa tidigare förvärvade kunskaper i bioinformatik samt söka upp, utvärdera, tillämpa och vid behov vidareutveckla existerande bioinformatiska verktyg
- kommunicera projektets fortskridande inom studentgruppen såväl med personer utan bioinformatisk specialkompetens
- kritiskt analysera, värdera och sammanställa erhållna resultat och presentera dessa i skriftlig och muntlig form
Innehåll
Studierna genomförs i form av mindre projektarbeten inom aktuella problemområden. Dessa kan vara t.ex. molekylära evolutionsmodeller, sekvensinpassning, genprediktion och genomannotering, fylogenianalys, expressionsanalyser och metaboliska reaktionsvägar eller proteinstrukturer och RNA-strukturer. Kursen innehåller också seminarier där projektens fortskridande diskuteras samt litteraturseminarier.
Undervisning
Projektarbete och seminarier.
Examination
Seminarier 2 hp och projekt 8 hp. Aktivt deltagande i forsknings-, projekt- och litteraturseminarier. Skriftlig och muntlig redovisning av projektarbeten.
Litteraturlista
Litteraturlista saknas.