Mikrobiell mångfald
Kursplan, Avancerad nivå, 1BG335
Kursen är avvecklad.
- Kod
- 1BG335
- Utbildningsnivå
- Avancerad nivå
- Huvudområde(n) med fördjupning
- Biologi A1N
- Betygsskala
- Underkänd (U), godkänd (3), icke utan beröm godkänd (4), med beröm godkänd (5)
- Fastställd av
- Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden, 27 april 2011
- Ansvarig institution
- Institutionen för biologisk grundutbildning
Behörighetskrav
120 hp, inklusive alt. 1) 60 hp biologi samt 30 hp kemi eller 30 hp geovetenskap; alt. 2) 90 hp biologi.
Mål
De övergripande målen med kursen är att ge en fördjupad kunskap om mikroorganismer genetiska och funktionella mångfald i olika ekosystem, samt en grundläggande förståelse för de metoder som används inom området. Efter godkänd kurs skall studenten kunna:
- redogöra för vanligt förekommande grupper av bakterier och arkéer i olika ekosystem, samt deras inblandning i biogeokemiska nyckelprocesser i dessa miljöer.
- redogöra för odlingsoberoende metoder för studier av mikrobiella samhällens sammansättning, och för enskilda gruppers funktion och förekomst.
- redogöra för genomik-baserade metoder för att studera mikrobiell mångfald i naturen, och för de mekanismer som ligger till grund för densamma.
- beskriva betydelsefulla interaktioner inom mikrobiella samhällen, och mellan mikroorganismer och olika växter och djur.
- värdera, syntetisera och presentera vetenskapliga studier av genetisk och funktionell mikrobiell mångfald i olika ekosystem.
- använda de bioinformatiska verktyg och databaser som vanligen används för att studera mikrobiell mångfald.
Innehåll
Mikrobiell mångfald i akvatiska och terrestra system, samt i olika typer av extrema miljöer och andra modellsystem. Tyngdpunkten ligger dels på de molekylära metoder som används inom forskningsfältet, dels på vilken betydelse mångfald har för mikrobiella samhällens funktion i olika ekosystem, samt på de mekanismer som skapar och reglerar mångfald inom mikrobiella samhällen. De senaste teknikerna och rönen inom metagenomiken, dvs. direkt DNA-sekvensering av hela mikrobiella samhällen från olika ekosystem, diskuteras ingående. Under kursens senare del genomför studenterna en litteratursammanställning inom ett fördjupningsområde som bestäms i samråd med kursledningen. Denna litteraturöversikt presenteras såväl skriftligt som muntligt i seminarieform.
Undervisning
Undervisningen består av föreläsningar och laborationer.
Examination
Skriftlig tentamen motsvarande 3 hp, godkänd övning samt godkänt fördjupningsarbete motsvarande 2 hp.
Övergångsbestämmelser
Kursen kan ej samtidigt tillgodoräknas i examen med 1BG 339 Mikrobiell mångfald 10 hp.