Behörighetskrav

Kandidatexamen inklusive 15 hp matematik och statistik samt 45 hp biologi varav 30 hp i molekylärbiologi, cellbiologi, evolution och/eller genetik.

Mål

Efter godkänd kurs ska studenten kunna

• redogöra för och utföra uppgifter som kräver kännedom om nyckelbegrepp inom beräkningsvetenskap och statistik;
• beskriva och använda de algoritmer och metoder som ingår i kursen;
• undersöka egenskaper hos beräkningsalgoritmer, matematiska och statistiska modeller med hjälp av de analysförfaranden som ingår i kursen;
• tillämpa grundläggande försöksplaneringsteknik;
• lösa mindre beräkningsproblem på ett strukturerart sätt (lösa problemet stegvis genom att dela upp i delproblem) och implementera i Matlab;
• skriva program i C för att lösa vetenskapliga problem inom biologi och beräkningsområdena;

Innehåll

Kursen består av tre delar: beräkningsvetenskap och grundläggande programmering, statistik och multivariat analys, programmering i C.

Del 1 (3 hp): Matriser, vektorer och lösning av linjära ekvationsstem med LU-faktorisering, numerisk lösning av integraler, Introduktion till Monte Carlometoder. Användning av Matlab och grunderna i programmering, t ex programmeringsstrukturer (if, for, while) och funktioner.

Del 2 (4 hp): Statistik och multivarat analys: Grunderna i statistik (fördelningar, väntevärde, varians, standardavvikelse etc.). Principalkomponentanalys. Prediktiv multivariat analys.

Del 3 (3 hp): Programmering: Programmering, testning och debugging i C. Datatyper, reguljära uttryck, funktioner och moduler. Innehållet och upplägget är i hög grad tillämpningsdrivet där problem inom biologi används i uppgifter och inlämninsuppgifter.

Undervisning

Föreläsningar och lektioner, laborationer, inlämningsuppgifter.

Examination

Skriftliga prov (del 1 och del 2). Inlämningsuppgifter (del 1, del 2 och del 3).