Allmänt

Kursen ingår i masterprogram i läkemedelsmodellering och är valbar inom apotekarprogrammet.

Behörighetskrav

150 hp varav 120 hp inom biomedicin, farmaceutisk vetenskap, naturvetenskap och/eller teknik. Tidigare studier ska innehålla 10 hp allmän och organisk kemi. Genomgången kurs Läkemedelskemi med datorbaserad läkemedelsdesign. Dessutom krävs kunskaper i engelska motsvarande Engelska 6. (Med en svensk kandidatexamen uppfylls kravet på engelska.)

Mål

Efter fullgjord kurs ska studenten kunna:

- beskriva olika typer av protein-ligand-interaktioner samt karakterisera bindningsfickor

- använda sökmetoder för att hitta föreningar med specifika egenskaper i substansdatabaser

- sätta upp, utföra och utvärdera virtuell sållning av stora dataset med hjälp av olika metoder

- redogöra för och använda metoder för molekyldynamiksimuleringar och fria energiberäkningar

- redogöra för och använda kvantkemiska metoder vid utveckling av läkemedelsmolekyler

-

Innehåll

Kursen inbegriper en fördjupning i metoder och strategier som används i läkemedelskemisk forskning med inriktning på datorbaserad läkemedelsdesign. Kursen behandlar begrepp och metoder såsom protein-ligand-interaktioner, dockning, kemoinformatik, likhetssökning, molekyldynamiksimuleringar, fria energiberäkningar, samt kvantkemi. Applikationer av dessa tekniker inom virtuell screening, strukturbaserad design samt ligandbaserad design kommer att belysas och praktiskt användas i datorövningar under kursen.

Undervisning

Undervisningen meddelas i form av självstudier, seminarier och datorlaborationer. Kursen kan komma att ges på engelska.

Obligatoriska moment: seminarier och datorlaborationer.

Examination

Individuell skriftlig examination sker i slutet av kursen. För godkänd kurs krävs godkända obligatoriska moment (Datorövningar, 3 hp) samt godkänd skriftlig examination (Tentamen, 4,5 hp).

Om särskilda skäl finns får examinator göra undantag från det angivna examinationssättet och medge att en student examineras på annat sätt. Särskilda skäl kan t. ex. vara besked om särskilt pedagogiskt stöd från universitetets samordnare.

Övriga föreskrifter

Kursen kan inte ingå i examen tillsammans med 3FK179 "Avancerad organisk kemi med inriktning mot läkemedelssyntes alternativt molekylmodellering", 15 hp, på grund av delvis överlappande innehåll. Kursen ersätter och motsvarar 3FK181.