Bioinformatik på nätet
Kursplan, Grundnivå, 1BG425
- Kod
- 1BG425
- Utbildningsnivå
- Grundnivå
- Huvudområde(n) med fördjupning
- Biologi G2F
- Betygsskala
- Underkänd (U), godkänd (G)
- Fastställd av
- Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden, 9 februari 2024
- Ansvarig institution
- Institutionen för biologisk grundutbildning
Behörighetskrav
60 hp biologi alternativt 45 hp biologi och 15 hp kemi eller geovetenskap.
Mål
Efter godkänd kurs ska studenten kunna:
- söka efter biologisk information på webben.
- använda enkla datorbaserade verktyg för studier av DNA-sekvenser och proteinstrukturer.
- lösa biologiska problem med hjälp av bioinformatiska verktyg.
- tolka resultat vid användning av datorbaserade metoder.
Innehåll
Följande problemområden ingår: Sammanställning av sekvensdata. Grundläggande sekvensanalys. Databaser och databassökningar. Mönster i DNA-sekvenser. Sekundärstrukturer. Proteiners tredimensionella strukturer. Linjeringar. Fylogenetiska rekonstruktioner. Metaboliska rekonstruktioner.
Undervisning
Undervisningen ges i form av en serie problembaserade datorövningar.
Examination
Problembaserade datorövningar (3 hp). Dessutom anordnas ett övergripande prov vid slutet av kursen (2 hp).
Om särskilda skäl finns får examinator göra undantag från det angivna examinationssättet och medge att en enskild student examineras på annat sätt. Särskilda skäl kan t.ex. vara besked om särskilt pedagogiskt stöd från universitetets samordnare för studenter med funktionsnedsättning.
Övriga föreskrifter
Kursen kan inte ingå i examen tillsammans med 1MB438.