Behörighetskrav

Alt 1. 120 hp inom civilingenjörsprogrammet i molekylär bioteknik inklusive Bioteknisk metodik, Genomik och bioinformatik. Engelska 6. (Med en svensk kandidatexamen uppfylls kravet på engelska.)

Alt 2. 120 hp inklusive Introduktion till bioinformatik, Programmeringsteknik I, Introduktion till statistik för livsvetenskaper. Engelska 6. (Med en svensk kandidatexamen uppfylls kravet på engelska.)

Alt 3. 120 hp inklusive Introduktion till bioinformatik, Introduktion till statistik för livsvetenskaper och Introduktion till molekylärbiologi, genetik och evolution. Engelska 6. (Med en svensk kandidatexamen uppfylls kravet på engelska.)

Mål

Efter godkänd kurs ska studenten kunna:

• redogöra för och jämföra metoder för att studera proteom och metabolom
• motivera val av metoder och utföra grundläggande försöksplanering för givna biologiska och biomedicinska problem
• utföra rådataanalys på insamlad data, såsom identifiering av peptider/proteiner/metaboliter och jämförelse av olika grupper av prov med avseende på proteom och metabolom
• redogöra för applikationer av proteomik och metabolomik inom biomedicin och biologi

Innehåll

Introduktion till proteomik och metabolomik. Metoder med tillhörande strategier för rådataanalys avsedda för att studera proteom, särskilt masspektrometri- och antikroppsbaserade metoder. Mätmetoder med tillhörande metoder för rådataanalys avsedda att studera metabolomet, särskilt masspektrometri och NMR-spektroskopi. Grundläggande experimentell design och strategier för jämförande proteomik och metabolomik. Publika databasresurser för datautvärdering och tolkning av resultaten. Tillämpningsexempel inom medicin och biologi.

Undervisning

Föreläsningar, seminarier, och datorlaborationer.

Examination

Skriftlig tentamen (3 hp), seminarier och datorlaborationer (2 hp). Slutbetyget erhålles såsom en sammanvägning av resultatet av de ingående momenten.

Om särskilda skäl finns får examinator göra undantag från det angivna examinationssättet och medge att en enskild student examineras på annat sätt. Särskilda skäl kan t.ex. vara besked om särskilt pedagogiskt stöd från universitetets samordnare för studenter med funktionsnedsättning.

Övriga föreskrifter

Kursen kan ej tillgodoräknas i examen samtidigt med Proteomik och metabolomik 5 hp (1MB448)