Proteinprofilering av filamentösa N2-fixerande cyanobakterier för H2-produktion

Vårt projekt

Det övergripande målet med detta projekt är att utforska potentialen hos cyanobakterier att bli effektiva producenter av H2 som en framtida energibärare. Cyanobakterier är prokaryoter, som kan använda solenergi och H2O för H2-produktion. Vi kartlägger de metaboliska processer som är involverade i vätemetabolismen, med fokus på att identifiera och ta bort flaskhalsar i produktionen. Många olika tillvägagångssätt behövs för att utforska den fulla potentialen hos cyanobakterier som framtida H2-producenter. Vår strategi är att använda kvalitativ och kvantitativ proteomik med hög genomströmning för att utforska de dynamiska förändringarna som sker i cellerna under olika tillväxtförhållanden, och att bestämma omprogrammeringen av metabolism när vätemetabolismen modifieras. Som modellorganismer används N2-fixerande filamentösa cyanobakterier med fullt sekvenserade och kommenterade genom, vilket är en förutsättning för storskaligt proteomiskt arbete. Hagelgevär (icke-gelbaserad) såväl som gelbaserad proteomik används. För att kunna karakterisera förändringar i uttryck av proteiner under olika förhållanden, i specifika celltyper såväl som i konstruerade stammar av cyanobakterier, använder vi iTRAQ (peptidtagging-metod) tillsammans med "state of the art", masspektrometri.