Fredrik Swartling – Mekanismer bakom hjärntumörer hos barn
I vår forskning studerar vi hur hjärncancer hos barn utvecklas och om vi kan hitta nya behandlingar mot dessa tumörer. Med avancerade modellsystem och singelcellsanalys studerar vi genetiska förändringar och proteiner som regleras på fel sätt i hjärntumörer. Vi försöker även förstå varför vissa tumörer återfaller och hur det kan behandlas.
MYC-proteiner som MYC och MYCN är ofta överproducerade i den maligna hjärntumören medulloblastom som drabbar barn, medan andra tillväxtfaktorer som PDGF ofta finns i ökad mängd i olika typer av elakartade gliom.
Vi använder olika modeller för att efterlikna de tumörer som orsakas av dessa proteiner och studerar tumörceller som odlas i så kallade stamcellskulturer eller som 3D-kulturer, så kallade organoider. Vi vill identifiera vilka celler i hjärnan som kan utgöra ursprungsceller för hjärntumörer och jämför därför dessa celltyper med prover och celler från hjärntumörpatienter. Här studerar vi faktorer som t.ex. proteinet SOX9 som är viktigt för både stamcellsbiologi och cancercellens motståndskraft mot standardbehandling.
Bromsa tumören och förhindra återfall
Vi har under olika stadier av tumörutvecklingen upptäckt att MYC- och PDGF-proteiner samverkar med andra proteiner som vi nu hoppas vi kan använda som mål för att försöka bromsa hjärntumörens framfart och även hindra återfall av tumörerna. Vi använder förutom avancerad sekvensering på singelcellsnivå även avancerad bioinformatisk analys och målinriktad terapi för att förstå hur behandlingsresistens uppstår vid återfall.
Vi hoppas att våra upptäckter kan ge en ökad förståelse för hur man ska kunna behandla dessa allvarliga cancerformer.
Publikationer
Drivers Underlying Metastasis and Relapse in Medulloblastoma and Targeting Strategies
Ingår i Cancers, 2024
An Indolin-3-imine Photobase and pH Sensitive Fluorophore
Ingår i ChemPhotoChem, 2023
Ingår i Nature Communications, 2023
Identification of ATF3 as a novel protective signature of quiescent colorectal tumor cells
Ingår i Cell Death and Disease, 2023
Novel cancer gene discovery using a forward genetic screen in RCAS-PDGFB-driven gliomas
Ingår i Neuro-Oncology, s. 97-107, 2023
Photoinduced ring‐opening and phototoxicity of an indolin‐3‐one derivative
Ingår i Chemistry - A European Journal, 2023
Ingår i Cell Reports, 2022
Dormant SOX9-Positive Cells Facilitate MYC-Driven Recurrence of Medulloblastoma
Ingår i Cancer Research, s. 4586-4603, 2022
Ingår i Cancers, 2022
- DOI för Iron Chelator VLX600 Inhibits Mitochondrial Respiration and Promotes Sensitization of Neuroblastoma Cells in Nutrition-Restricted Conditions
- Ladda ner fulltext (pdf) av Iron Chelator VLX600 Inhibits Mitochondrial Respiration and Promotes Sensitization of Neuroblastoma Cells in Nutrition-Restricted Conditions
Ingår i RSC Advances, s. 14544-14550, 2022
Profiling chromatin accessibility in formalin-fixed paraffin-embedded samples
Ingår i Genome Research, s. 150-161, 2022
Ingår i Journal for ImmunoTherapy of Cancer, 2021
Ingår i Nucleic Acids Research, 2021
Ingår i RSC Advances, s. 23960-23967, 2021
Ingår i Molecular Cancer Research, s. 1831-1839, 2021
Targeting MYCN in Molecularly Defined Malignant Brain Tumors
Ingår i Frontiers in Oncology, 2021
Ingår i Cancer Research, s. 2101-2115, 2021
A Patient-Derived Cell Atlas Informs Precision Targeting of Glioblastoma
Ingår i Cell Reports, 2020
Medulloblastomics revisited: biological and clinical insights from thousands of patients
Ingår i Nature Reviews. Cancer, s. 42-56, 2020
Modeling SHH-driven medulloblastoma with patient iPS cell-derived neural stem cells
Ingår i Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, s. 20127-20138, 2020
Ingår i Cancers, 2020
Perturbation-based gene regulatory network inference to unravel oncogenic mechanisms
Ingår i Scientific Reports, 2020
Ingår i Bioinformatics, s. 3357-3364, 2019
BET and Aurora Kinase A inhibitors synergize against MYCN-positive human glioblastoma cells
Ingår i Cell Death and Disease, 2019
Ingår i Cell Stem Cell, s. 433-+, 2019
Ingår i Cell Stem Cell, s. 855-870, 2019
Ingår i Journal of Pathology, s. 228-240, 2019
Combined BET bromodomain and CDK2 inhibition in MYC-driven medulloblastoma
Ingår i Oncogene, s. 2850-2862, 2018
GMYC: A Novel Inducible Transgenic Model of Group 3 Medulloblastoma
Ingår i Neuro-Oncology, s. 137-137, 2018
Ingår i Brain, s. 1300-1319, 2018
Microglia Induce PDGFRB Expression in Glioma Cells to Enhance Their Migratory Capacity
Ingår i iScience, s. 71-83, 2018
Notch1 regulates the initiation of metastasis and self-renewal of Group 3 medulloblastoma
Ingår i Nature Communications, 2018
Ingår i Neuro-Oncology, s. 139-139, 2018
Loss of Conservation of Graph Centralities in Reverse-engineered Transcriptional Regulatory Networks
Ingår i Methodology and Computing in Applied Probability, s. 1089-1105, 2017
Ingår i Frontiers in Oncology, 2017
Medulloblastoma: experimental models and reality
Ingår i Acta Neuropathologica, s. 679-689, 2017
Modeling and Targeting MYC Genes in Childhood Brain Tumors
Ingår i Genes, 2017
Ingår i Cancer Research, s. 802-812, 2017
Ingår i Oncotarget, s. 24815-24827, 2017
- DOI för Serglycin as a potential biomarker for glioma: association of serglycin expression, extent of mast cell recruitment and glioblastoma progression
- Ladda ner fulltext (pdf) av Serglycin as a potential biomarker for glioma: association of serglycin expression, extent of mast cell recruitment and glioblastoma progression
Targeting SOX9 for degradation to inhibit chemoresistance, metastatic spread, and recurrence
Ingår i Molecular & Cellular Oncology, 2017
FBW7 suppression leads to SOX9 stabilization and increased malignancy in medulloblastoma
Ingår i EMBO Journal, s. 2192-2212, 2016
Ingår i PLOS Genetics, 2016
- DOI för Utilizing the Dog Genome in the Search for Novel Candidate Genes Involved in Glioma Development-Genome Wide Association Mapping followed by Targeted Massive Parallel Sequencing Identifies a Strongly Associated Locus
- Ladda ner fulltext (pdf) av Utilizing the Dog Genome in the Search for Novel Candidate Genes Involved in Glioma Development-Genome Wide Association Mapping followed by Targeted Massive Parallel Sequencing Identifies a Strongly Associated Locus
Ingår i Cancer Cell, s. 72-84, 2015
Deregulated proliferation and differentiation in brain tumors
Ingår i Cell and Tissue Research, s. 225-254, 2015
BET Bromodomain Inhibition of MYC-Amplified Medulloblastoma
Ingår i Clinical Cancer Research, s. 912-925, 2014
Glial origin for MYCN-driven medulloblastoma and targeted prosenescence therapies
Ingår i Cancer Research, 2014
Ingår i Neuro-Oncology, s. 90-90, 2014
Metastasis and tumor recurrence from rare SOX9-positive cells in Group 4 medulloblastoma
Ingår i Cancer Research, 2014
Metastasis and Tumor Recurrence from Rare SOX9-Positive Cells in MYCN-Driven Medulloblastoma
Ingår i Neuro-Oncology, 2014
Ingår i Cancer Research, 2014
Oncoprotein stabilization in brain tumors
Ingår i Oncogene, s. 4709-4721, 2014
Signals that regulate the oncogenic fate of neural stem cells and progenitors
Ingår i Experimental Neurology, s. 56-68, 2014
A glial origin for medulloblastoma and inhibition of MYCN stabilization
Ingår i Cancer Research, 2013
Humanized Mouse Models for Medulloblastoma
Ingår i Neuro-Oncology, s. 30-30, 2013
Targeting the Translational Apparatus in Mycn-Driven Medulloblastoma
Ingår i Neuro-Oncology, s. 16-16, 2013
What underlies the diversity of brain tumors?
Ingår i Cancer Metastasis Review, s. 5-24, 2013
Distinct Neural Stem Cell Populations Give Rise to Disparate Brain Tumors in Response to N-MYC
Ingår i Cancer Cell, s. 601-613, 2012
miRNA-21 is developmentally regulated in mouse brain and is co-expressed with SOX2 in glioma
Ingår i BMC Cancer, s. 378, 2012
Myc proteins in brain tumor development and maintenance
Ingår i Upsala Journal of Medical Sciences, s. 122-131, 2012
Pleiotropic role for MYCN in medulloblastoma
Ingår i Genes & Development, s. 1059-1072, 2010
Ingår i Oncogene, s. 3121-3131, 2009
Identifying Candidate Genes Involved in Brain Tumor Formation
Ingår i Upsala Journal of Medical Sciences, s. 1-38, 2008
Ingår i Oncogene, s. 3896-3905, 2005
Identification of candidate cancer-causing genes in mouse brain tumors by retroviral tagging
Ingår i Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, s. 11334-11337, 2004
Dormant SOX9-positive cells behind MYC-driven medulloblastoma recurrence